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地黄中介体亚基基因RgMed6 的分离与表达特性

更新时间:2015-10-26

【摘要】目的 克隆地黄中介体亚基基因RgMed6,分析其编码的蛋白序列特征和基因表达特性。方法 利用地黄转录组数据库进行同源比对,获得拟南芥Med6 的同源基因片段,通过序列拼接获得RgMed6 的全长开放阅读框(ORF),在NCBI上进行BLASTp 获得RgMed6 的同源蛋白,用MAFFT 进行多序列联配,应用MEGA 6.0 构建系统进化树,以实时荧光定量PCR 技术检测RgMed6 在地黄不同组织以及逆境胁迫下的相对表达量。结果 获得1 条924 bp 的cDNA 序列,包含1 个771bp 的完整ORF,编码256 个氨基酸,具有Med6 蛋白的典型结构域和1 个潜在的核定位信号序列。RgMed6 在检测的5 个地黄组织(器官)中均有表达,其中在地黄叶片里表达强度最大,其次为花蕾,在茎中表达量最低。在连作地黄块根中RgMed6的表达量降低,NaCl 胁迫处理下RgMed6 的表达量升高。结论 首次克隆了地黄中介体亚基基因RgMed6,为阐明其在地黄生长发育和逆境胁迫中的分子功能奠定基础。

【关键词】

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