黄芪饮片miRNA 谱及热力学的稳定性研究

更新时间:2015-10-26

【摘要】目的 为更好了解药用黄芪微小RNA（miRNA）被机体摄入和吸收的情况，试图建立黄芪miRNA 谱，为今后黄芪饮片药理学研究奠定基础。方法 以经干燥、高温和微波处理的黄芪煎煮液为样本，采用高通量深度测序方法以获取未知的miRNA 序列。结果 经测序得到药用黄芪9 931 049 个小RNA 读数。经与miRBase 21 数据库所有植物种类潜在发卡型结构比对，分析和构建了黄芪饮片煎煮液miRNA 谱，并确定了1 个保守的miRNA 和9 个新发现的miRNA。经进一步生物学信息分析，发现12 种I 类小干扰性RNA（small interfering RNAs，siRNAs）序列，其5’端对热力学不稳定，3’端种子区域对热力学高度稳定。结论 首次揭示了经热力学处理后黄芪饮片的miRNA 谱，I 类siRNAs 是潜在的可利用的植物药的生物化学分子，有助于今后中药在表观遗传学方面的深入研究。

【关键词】 微小RNA 膜荚黄芪 高通量测序 小干扰性RNA 热力学稳定性 中药

阅读全文