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长柄石杉L-赖氨酸脱羧酶基因克隆及序列分析

更新时间:2015-11-09

【摘要】目的 在对长柄石杉Huperzia serrata、闽浙马尾杉Phlegariurus minchegensis、华南马尾杉Phlegariurus austrosinicus和有柄马尾杉Phlegariurus petiolatus 4 种石杉科植物的L-赖氨酸脱羧酶(L-lysine decarboxylase,LDC)基因编码区进行克隆的基础上,对长柄石杉的LDC 基因全长序列进行分析并预测其蛋白结构。方法 采用RT-PCR 技术,以石杉科植物叶片提取的总RNA为模板克隆得到LDC基因编码区序列,通过BLAST 比对和MEGA5.0 软件对克隆的序列进行分析。采用RACE技术获得石杉科广布种长柄石杉的LDC 基因全长序列,并对其蛋白的二级结构及三维结构进行预测分析。结果 克隆的4种石杉科植物LDC 基因序列与数据库中被注释为编码LDC 的基因序列保持高度的相似性,长柄石杉LDC 蛋白与NCBI 中的蛇足石杉LDC 氨基酸序列相似度很高,与蕨类植物江南卷柏的同源性也较高。长柄石杉LDC 基因编码区全长为1 266 bp,编码403 个氨基酸,GenBank 登录号KF040056。结论 克隆得到4 种石杉科植物的LDC 基因,分析了长柄石杉LDC 基因的全长序列并预测其蛋白结构,为进一步阐明石杉科植物石杉碱甲生物合成途径奠定基础。

【关键词】

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